袁崇焕肃然起身，历数其十二大罪：“专恃欺罔、骄蹇不法、虚报战功、苛虐军民、私通外藩……你道本部院是个书生，本部院却是朝廷首将！”

毛文龙面色惨白，挣扎道：“某数年辛苦，何谓无功？”

“你有功，朝廷岂负你？但你今日之罪，七尺童子无不恨不能食你肉！”袁崇焕厉声喝道，随即命令，“推出帐外，斩！”

刀光闪过，毛文龙人头落地。袁崇焕随即安抚其部众，将东江军改编为四协，直属督师管辖。然而在受抚的将领中，孔有德、耿仲明等人低垂的脸上，却藏着难以察觉的怨毒。

消息传到北京，举朝震惊。虽然毛文龙确有其罪，但擅杀大将，已犯大忌。崇祯闻奏，“意殊骇”，但既已授权，只得“优旨褒答”。然而在御书房内，年轻的天子对着毛文龙的罪状奏疏，眉头紧锁，第一次对袁崇焕产生了疑虑。

“皇上，袁督师此举，虽是为国除害，然未免太过专擅。”首辅温体仁小心翼翼地说道。

崇祯不语，只是将手中的奏疏攥得更紧。

此时的辽东，更大的危机正在酝酿。皇太极在沈阳得知毛文龙被杀，抚掌大笑:“袁蛮子自毁长城，天助我也！”

范文程在旁进言：“汗王，如今东江暂乱，明军防线出现缺口。不如趁此机会，绕道蒙古，直捣明京。”

皇太极颔首：“传令各旗，即刻整军备战。”

崇祯二年十月，朔风渐起。袁崇焕正在山海关整顿防务，突然探马飞报：皇太极亲率十万大军，绕道蒙古，突破大安口、龙井关，直逼京师！

“什么？”袁崇焕拍案而起，“蓟州防线何在？”

“蓟辽总督刘策疏于防范，建虏已长驱直入！”

袁崇焕面色铁青，急令山海关总兵赵率教率四千精骑驰援遵化，自率祖大寿、何可纲等九千关宁铁骑昼夜兼程入关。

然而，命运的残酷超乎想象。赵率教在遵化遭遇埋伏，浴血奋战，终因寡不敌众，全军覆没。这位历经宁远、宁锦血战的老将，最终马革裹尸。

当袁崇焕赶到蓟州时，皇太极已巧妙绕过防线，直扑北京。袁崇焕只能率军紧追，终于在十一月二十日抵达北京广渠门外。

九千关宁铁骑，人马疲惫，甲胄不整。崇祯帝在平台召见，赐貂裘、银币，但目光中已存疑虑。