太初二年（前103年），由于连年战争和灾害，再加上朝廷大兴土木，汉朝经济受到了极大的冲击，当时主管祭祀的官员便上奏汉武帝，说雍城五畤已经没有了煮熟的牲牢作为祭品，祭祀时芬芳之味难以凑齐。

无奈之下，汉武帝只好下令祠官，除了五月的尝驹祭以及天子亲自郊祀时采用真正的牲畜外，在举行牲礼和祭祀山川时需要用到驹的，一律以木偶马代替。

太初三年（前102年），汉武帝再一次东巡来到海边，查问方士们出海寻仙的情况，仍然没有任何结果，汉武帝大失所望。因为担心触怒汉武帝招来杀身之祸，有方士便说，“黄帝时，建造了五个城邑、十二座楼，用来迎接、等候神人，称为迎年，如今却还没有齐备。”

汉武帝于是下诏按照方士所言筹备，并称之为明年，之后汉武帝又亲自行礼祭祀了天帝。

曾献明堂图的公玉带则说，“黄帝虽然封祭了泰山，然而当时风后、封巨、岐伯等人却都建议封东泰山，禅祭凡山，与福瑞相合，然后才能产生不死。”

听了公玉带的建议后，汉武帝便又命人准备了祭祀用具，率众来到了东泰山，结果发现东泰山极为矮小，与名声根本不相称，便没有亲自祭祀，只是命令祠官代为行礼，而且没有在这里举行封禅仪式。同时，又命公玉带留在东泰山，负责主持这里的祭祀工作，并迎候神人。

夏天时，汉武帝又返回了泰山，像以前那样举行五年一次的修封礼，此外还增加了禅祭石闾的礼仪。石闾，也就是石闾山，在泰山以南，有不少方士都说这里是仙人居住的门闾，因此汉武帝才亲自进行禅祭。

此后数年，由于汉朝与匈奴的战事再起，且汉朝多次兵败匈奴，再加上国家经济的影响，以及方士们求仙屡屡无果，汉武帝对于求仙之事渐渐有所懈怠。

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直到天汉四年（前97年）的“余吾水之战”后，随着汉匈关系再度缓和，汉武帝才再一次到泰山举行了修封礼，回来时路过恒山，又在这里举行了祭祀。

汉武帝在位这数十年来，一直醉心于神仙长生术，汉朝的祭祀活动极为频繁，汉朝的祭礼也因此得以完善，其中泰一神和后土神，由汉武帝每隔三年亲自祭祀；薄忌建议设立的泰一祠、三一、冥羊、马行和赤星等五处神祠，则由宽舒等祀官，每年按照时节进行祭祀。以上六庙，平时皆交由太祝官进行管理。同时，汉武帝泰山封禅后，汉朝的封禅制度也得以形成定制。

不过，由于当时各种流派学说难以统一，这数十年间的祭祀极为混乱，除了以上六庙的祭祀对象因为神话体系的建立，得到国家层面确认，祀礼基本得以固定外，其他祠庙的管理就混乱了很多，那些经方士建议所立的祠庙，都交由建议者主持，人死庙废。此外，八神等神、明年、凡山等名祠，以及汉武帝出行时路过的名山名水，则是汉武帝路过才进行祭祀，离去便停止了祭祀。

由于那些出海寻仙和在各地迎候神仙的方士，始终没有应验，公孙卿还知道以神人的脚印来辩解，其他人更是空耗国家钱粮而毫无声息。这种情况下，汉武帝越来越对那些方士的怪诞、迂阔之语感到厌倦，因而自天汉四年（前97年）举行了修封礼后，汉武帝再也没有进行过大规模的出巡和寻仙。

此后，汉武帝虽然仍对长生求仙存有一丝幻想，希望日后能够遇到有真本事方士，但对于现有的这些方士，却是彻底失望了，因此那些方士虽然仍旧时常给汉武帝提出各种建议，但汉武帝再也没有采纳。